Um novo aplicativo de sequenciamento de genoma foi desenvolvido por cientistas que podem analisar o genoma do SARS-CoV-2 em minutos. O aplicativo chamado Genopo está disponível para download em Google Play Store de graça. Segundo estudo publicado na revista Communications Biology, o app Genopo demorou menos de 30 minutos, dependendo da marca do smartphone, para determinar a seqüência completa do genoma do coronavírus humano.
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Sobre o aplicativo Genopo
O estudo descreve o Genopo como um kit de ferramentas móvel para análise de sequenciamento de nanopore. Genopo compacta ferramentas de bioinformática populares em um aplicativo Android, permitindo computação totalmente portátil. Este é um desenvolvimento único porque é o primeiro aplicativo de smartphone para análise de sequenciamento de nanoporos. Existe um dispositivo portátil para sequenciamento de DNA chamado MinION, desenvolvido pela Oxford Nanopore Technologies (ONT), mas o Genopo é o primeiro aplicativo móvel para esse fim.
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O desenvolvimento do Genopo também é importante porque nem todos têm acesso à computação de alta potência para usar um dispositivo como o MinION, mas a maioria das pessoas tem um smartphone nos dias de hoje, o que lhes permitirá acessar o aplicativo Android gratuito de forma mais flexível. Para usar Genopo e produzir resultados em menos de 30 minutos, é aconselhável um mínimo de 4GB de RAM, como comprovado durante a execução do workflow.
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O aplicativo pode executar um fluxo de trabalho de bioinformática em um conjunto de dados de sequenciamento nanopore copiado ou baixado para o armazenamento do dispositivo. “O Genopo já oferece suporte a uma variedade de ferramentas populares e é projetado para compatibilidade com muitas análises comuns de bioinformática, incluindo alinhamento de sequência, detecção de variantes e perfil de metilação de DNA”, disseram os autores no estudo.
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